实验干货|免疫共沉淀(CoIP)实验原理及应用

2023 / 01 / 132768

免疫共沉淀与免疫沉淀技术所使用的原理与方法大致相似,所不同的是,在免疫共沉淀中,对靶蛋白的结合与沉淀由另一个与之发生相互作用的蛋白替代。在免疫共沉淀或免疫沉淀的基础上,通过进一步与其它技术的结合,如聚丙烯酰胺凝胶电泳,还可进一步对靶蛋白的的分子量等特性进行鉴定。下面对此进行详细介绍。
实验原理
(1)免疫沉淀(ImmunoprecipitationIP):利用抗原抗体特异性反应,对某个特定蛋白纯化富集的方法,主要过程包括捕获和固定。
(2)免疫共沉淀(Co-ImmunoprecipitationCoIP:CoIP是在IP实验的基础上进行的扩展,主要用于蛋白之间的互作研究,常被用于鉴定特定蛋白复合物的中已知或未知的蛋白组分。其原理是基于抗体与抗原(靶蛋白)之间的特异性结合,此时如果样品溶液中存在能与靶蛋白相互作用的目的蛋白,会一同被拉下来,随后利用SDS-PAGEWestern Blot等方法对得到的目标蛋白进行分析,进而证明两者间的相互作用。
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关于实验

1、CoIP的实验操作流程

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2、注意事项
*确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白,单克隆抗体具有特异性强、可大量生产、易标准化等优点,使用单克隆抗体有助于避免污染的发生;
要确保抗体的特异性,如果抗体不能和细胞溶解物中的抗原结合,则不会引起共沉淀反应;确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中,而不是由于细胞的溶解才发生的。
3、实验技巧
为了确保最终得到的结果是天然状态下的相互作用,而不是由于某些方面造成的人工相互作用(也就是“假阳性”),在Co-IP 的实验设计过程中,需要设置正确的对照。假设Co-IP 实验的实验组为“磁珠+抗体+靶蛋白X+目的蛋白Y”,则可能出现的“假阳性”及对应需要设置的实验对照如下表所示:

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4、CoIP实验结果解读

Lgr5-mediated p53 Repression through PDCD5 leads to doxorubicin resistance in Hepatocellular CarcinomaIF11.600
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western blotting结果显示,在共转染Flag-Lgr5Myc-PDCD5的细胞中,抗flag抗体能免疫沉淀Flag-Lgr5/Myc-PDCD5复合物,而在仅转染Flag-Lgr5的细胞中,抗flag抗体不能免疫沉淀Myc-PDCD5。抗Lgr5抗体可以检测抗PDCD5沉淀的免疫复合体中的Lgr5,而不能检测IgG抗体。抗Lgr5抗体的免疫沉淀也证实了Lgr5PDCD5之间的相互作用。
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