以病毒为基础的基因载体，是一种常见的分子生物学工具，利用病毒载体可将目的基因传递至培养的细胞或是完整活体中。目前常用的病毒载体有慢病毒载体（Lentivirus Vector，LV），腺病毒载体（Adenovirus Vector，AdV）和腺相关病毒载体（Adeno-associated virus Vector）等。
小编为大家整理了4篇使用慢病毒、腺病毒、腺相关病毒的高分文章，有助于大家了解这三种病毒在实际应用中的区别，感兴趣的朋友可点击文章链接获取全文。
1.RNA binding protein IGF2BP1 synergizes with ETV6-RUNX1 to drive oncogenic signaling in B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia
在急性B淋巴细胞白血病中，RNA结合蛋白 IGF2BP1 与ETV6-RUNX1协同驱动致癌信号
J Exp Clin Cancer Res.（IF=11.3）
DOI: 10.1186/s13046-023-02810-1
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37670323/
急性淋巴细胞白血病（ALL）是最常见的小儿血液系统恶性肿瘤。ETV6::RUNX1（又称TEL-AML1）融合基因，是由12号染色体上的转录因子ETV6基因与21号染色体上的RUNX1序列断裂、重接形成，可影响造血干细胞的自我更新与分化，与白血病的发生、发展密切相关。IGF2BP1（胰岛素样生长因子 2 结合蛋白 1）是一种癌胚 RNA 结合蛋白，在ETV6::RUNX1阳性的 B-ALL （急性B淋巴细胞白血病）中特异性高表达。在这项研究中，作者主要研究了IGF2BP1在白血病中的作用机制及其与ETV6::RUNX1融合蛋白的协同作用。
摘要
IGF2BP1功能丧失抑制 B-ALL 细胞增殖，降低泼尼松龙耐药性：与缺乏ETV6-RUNX1易位的白血病细胞系（NALM6、RS4、11和THP1）相比，IGF2BP1的表达在mRNA和蛋白质水平上对ETV6:：RUNX1易位的细胞系（Reh、UoCB6、AT1和AT2）是特异性的。这与来自患者样本的IGF2BP1表达数据相符合。为了检测IGF2BP1缺失的影响，使用如前所述设计和克隆的3种不同sgRNA（sg1-3）在Reh-Cas9细胞系中进行敲除。IGF2BP1的蛋白质印迹显示，sg1和sg2导致IGF2BP1蛋白的完全敲除，而sg3导致部分敲除。选择sg1和sg2进行进一步的表型表征和分析。
通过MTS测定评估，IGF2BP1的完全敲除导致细胞增殖的显著降低。感染72小时后，与非靶向gRNA（NT）相比，sg1和sg2的细胞活力分别降低了约26%和约41%。IGF2BP1敲除逆转了泼尼松的耐药性，细胞对泼尼松表现出敏感性，sg1和sg2的IC50～1μM。即使在10μM浓度的泼尼松龙下，具有非靶向gRNA（NT）的细胞也是可行的，证实了耐药性。用5μM泼尼松治疗后，sg1（~60%）和sg2（~75%）对IGF2BP1进行KO后，细胞活力急剧下降。IGF2BP1在ETV6:：RUNX1阳性的B-ALL细胞系中特异性表达，其敲除降低了Reh细胞系中的肿瘤细胞增殖和泼尼松龙耐药性。
2.RNA-binding protein CCDC137 activates AKT signaling and promotes hepatocellular carcinoma through a novel non-canonical role of DGCR8 in mRNA localization
RNA结合蛋白CCDC137通过DGCR8在mRNA定位中的非典型作用激活AKT信号并促进肝细胞癌
RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达的重要调节因子。它们通过特定的结合域与RNA分子相互作用，并在RNA代谢中发挥关键作用，如转录、剪接、定位、降解和翻译。由于RBPs的广泛调节网络作用，其正常功能对于各种生物过程是必要的，RBPs的功能障碍可导致多种疾病，如遗传性疾病、细胞衰老和癌症。因此，识别RBPs的调节功能将促进对人类生理和病理活动的进一步了解。
肝细胞癌(HCC)占原发性肝癌的大多数，具有很高的转移潜力和不良预后。除了传统的治疗方法，包括手术、化疗和放射治疗，分子靶向治疗已经成为一种有前途的治疗策略。然而，由于缺乏有效可靠的分子靶点，分子靶向治疗的应用仍面临巨大挑战。越来越多的证据表明，RBPs与癌症的发展有关，包括癌症的增殖、转移、代谢失调和化疗耐药，并已成为癌症治疗的潜在靶点。RBPs也被报道与肝癌的发生有关，可作为诊断、预后和治疗的潜在工具。因此，对HCC相关RBPs的深入了解将为HCC的治疗提供新的线索。
摘要
为了检测CCDC137在肝癌发生中的作用，作者使用慢病毒载体，以空载体作为阴性对照，在Huh7和HCCLM3细胞中稳定过表达CCDC137（图2a，b）。使用结晶紫染色和球体形成试验分别评估细胞贴壁依赖和非贴壁依赖的增殖特性，结果显示，CCDC137的异位表达显著促进HCC细胞增殖（图2c-f）。
为了进一步验证CCDC137在HCC细胞中的作用，作者使用通过CRISPR抑制（CRS-PRi）的两种gRNA稳定地敲低CCDC137的表达（图2g）。两种gRNA都靶向CCDC137转录起始位点的下游，并引导非活性Cas9（dCas9）与KRAB抑制子结合，从而抑制CCDC137的转录（图2h，i）。正如预期的那样，CCDC137的缺失显著抑制了PLC/PRF/5和JHH-7细胞的贴壁依赖和非贴壁依赖增殖（图2j-m）。这些结果表明，CCDC137是肝癌发生过程中的一种致癌蛋白，在体外可以促进HCC细胞的贴壁依赖和非贴壁依赖性增殖。
J Extracell Vesicles.（IF=25.8）
DOI: 10.1002/jev2.12221
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35524442/
胰腺导管腺癌(PDAC)是胰腺癌中主要的肿瘤类型，其微环境包含以肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)为主的致密间质。大量证据表明，肿瘤细胞与CAFs之间的相互作用参与了肿瘤的发生发展，因此，进一步探索肿瘤与基质间的相互作用十分必要。血小板反应蛋白2（THBS2）是一种分泌型多功能糖蛋白，也是多种癌症相关的有效预后标记。研究发现THBS2在两种PDAC小鼠模型的胰腺上皮内瘤变(PanIN)基质以及PDAC患者的肿瘤组织中大量表达，然而THBS2在肿瘤间质中的细胞来源以及肿瘤间质相互作用因子在PDAC中的具体机制尚不清楚。
本研究通过定量蛋白质组学和免疫组化分析，发现PDAC中THBS2的高表达主要局限于间质，并与肿瘤进展和不良预后相关。RNA原位杂交证实，在基因工程小鼠模型中，CAFs而非肿瘤细胞在癌前病变中表达THBS2，且THBS2表达水平随疾病进展逐渐升高。机制上，癌细胞分泌的TGF-β1通过p-Smad2/3通路激活CAFs诱导THBS2的表达。因此，CAFs诱导的THBS2与膜受体整合素αvβ3/CD36结合，激活PDAC细胞中的MAPK通路，从而促进肿瘤在体内外的生长和黏附。抑制整合素αvβ3、CD36、MEK和JNK可挽救THBS2诱导的恶性表型。综上所述，TGF-β1-THBS2-整合素αvβ3/CD36-MAPK级联形成复杂的反馈回路，介导胰腺癌细胞与CAFs的相互作用。本研究揭示了THBS2有望作为阻断肿瘤-间质通讯的一种新治疗靶点。
摘要
为了研究CAFs产生的THBS2是否在人类胰腺癌细胞（PCC）进展中发挥功能作用，作者使用人胚胰腺组织来源的成纤维细胞CCC-HPE-2进行了后续的体外和体内实验。
作者利用慢病毒过表达载体（及慢病毒对照载体）生成了THBS2过表达的CAF细胞（及对照），结果发现培养过CAF-THBS2细胞的培养基（CAF-THBS2 CM）显著促进了BxPC-3细胞的增殖、集落形成和粘附。用重组人THBS2蛋白(rhTHBS2)处理BxPC-3细胞也得到了相同的结果。
作者进一步研究了THBS2对PCC体内致瘤性的影响。将BxPC-3与CAF-NC (BxPC-3 +CAF-NC组)或CAF-THBS2 (BxPC-3 + CAF-THBS2组)混合后经皮下注射BALB/c裸鼠，建立皮下移植模型，观察发现BxPC-3 +CAF-THBS2组肿瘤的大小和重量明显大于对照组。免疫组化结果显示，BxPC-3+CAF-THBS2组中THBS2和Ki-67（肿瘤增殖标记物）的表达水平高于BxPC-3 CAF-NC组，而α-SMA的表达没有显著差异。综上所述，这些数据表明CAF来源的THBS2能够促进PCC在体外和体内的进展。
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